刁协的话语很有力，突然之间让司马睿甚至有些要责怪祖逖的意思，不过此时司马睿心里毫无负担了，他总算可以为拒绝祖逖而心安理得了。
王师没能等来，却等来一纸司马睿拒绝出兵的诏书，祖逖那颗炽热的心顿时凉到了冰点。更让祖逖难过的是，居然朝中有人污蔑他通敌卖国，想到这儿祖逖更加愤懑不平，这一气便气倒了。
病中的祖逖长叹自己北伐之功，废于一夕，他想起了刘琨，想起了当初的闻鸡起舞，想起了自己的中流击楫。可是，这一切的一切都回不去了，弥留之际，祖逖喊来了弟弟祖约，将军事托付与他便阖目而逝了。祖逖死在雍丘，终年五十六岁。祖逖死后，北方百姓无不痛哭，豫州人民更是自发为其修建了祠堂，时时祭拜，就连远在江东的司马睿也追谥他为车骑将军。
“假使更有三年寿，石勒寻为阶下囚。”后世的胡曾曾经如此评价过祖逖，只是，即使祖逖多活三年，也未必能打得下河北，因为一个松散的国家根本无法给予他北伐支持！